小叶瓶尔小草根状茎颇粗大，直立，须状根丛生，常有2-3叶。营养叶叶柄长1.5-3厘米，因埋于土中，大部为灰绿色，叶片椭圆形或椭圆状卵形，长1.5-2厘米，宽约1厘米或稍宽，圆钝头或急尖头，先端有短尖，向基部为短楔形，近肉质，叶脉不明显。孢子叶全长4-5厘米，自营养叶的基部生出，孢子囊穗长约1厘米，较短粗，高出营养叶1-2倍，由10-18对孢子囊组成，先端有长尖头。
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