兽孔目早先被称为似哺乳爬行动物，是单孔亚纲中的一目。然而，当被用在遗传学上时，这一类通常包括哺乳类，哺乳类是兽孔目犬齿兽类的后代。演化的轨迹起源于早二叠纪（约开始于2.9亿年前），在我国最早发现的标本产自甘肃玉门大山口上二叠统的西大沟组。
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