明末于、刘2姓同时由前于庄迁此建村，因地处前于庄北，故改村名后于庄。清末至1939年隶属菏泽县。1940年划归郓南县三区，1942年归郓鄄巨菏办事处，1943年属临泽县，1944年为郓巨县六区辖。1949年属郓城县十一区，1952年隶八区。1958年初为黄安乡辖，同年秋属黄安公社杨庄大队。1978年从杨庄大队分出，自成后于庄大队。1984年初改为后于庄村民委员会，归徐垓乡，2001年2月隶黄安镇。
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